Thủ tục hải quan trong vận tải đa phương thức mới

Thủ tục hải quan trong vận tải đa phương thức đóng vai trò then chốt trong việc kết nối chuỗi cung ứng toàn cầu, đảm bảo hàng hóa lưu thông xuyên biên giới một cách hợp pháp và hiệu quả. Bài viết này sẽ cung cấp cái nhìn chi tiết và cập nhật nhất về quy trình, hồ sơ và các lưu ý quan trọng, đồng hành cùng ACC HCM giúp bạn vận hành thông suốt.

Mục lục

1. Thủ tục hải quan trong vận tải đa phương thức mới

Theo quy định tại Luật Hải quan 2014, sửa đổi 2025 và các văn bản hướng dẫn thi hành, thủ tục hải quan trong vận tải đa phương thức được hiểu là tổng thể các công việc mà người khai hải quan và cơ quan hải quan phải thực hiện theo quy định đối với hàng hóa vận chuyển bằng sự kết hợp của ít nhất hai phương thức vận tải khác nhau (đường biển, đường hàng không, đường bộ, đường sắt) thông qua một hợp đồng vận tải duy nhất. Quy trình thực hiện thủ tục hải quan trong vận tải đa phương thức được thực hiện theo các bước cơ bản sau đây:

Bước 1: Chuẩn bị và khai tờ khai hải quan điện tử

Doanh nghiệp tiến hành khai và gửi tờ khai hải quan điện tử đến Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử của Tổng cục Hải quan trước khi hàng hóa đến cửa khẩu hoặc trong thời hạn quy định. Việc khai báo phải chính xác, trung thực, đầy đủ các tiêu chí thông tin trên tờ khai theo đúng hướng dẫn. Sau khi khai, hệ thống sẽ tiếp nhận và phân luồng tờ khai (Luồng xanh: miễn kiểm tra chi tiết; Luồng vàng: kiểm tra hồ sơ; Luồng đỏ: kiểm tra thực tế hàng hóa).

Bước 2: Nộp hồ sơ và chờ cơ quan hải quan xử lý

Doanh nghiệp hoặc đại lý hải quan nộp bộ hồ sơ giấy (nếu có yêu cầu) tại Chi cục Hải quan nơi làm thủ tục. Cơ quan hải quan có trách nhiệm kiểm tra, đối chiếu thông tin khai báo trên hệ thống với hồ sơ giấy. Thời gian hoàn thành kiểm tra hồ sơ và thông quan được quy định cụ thể: đối với luồng xanh, thời gian xử lý thường rất nhanh (trong ngày); đối với luồng vàng và đỏ, thời gian có thể kéo dài hơn tùy thuộc vào mức độ phức tạp của hàng hóa và yêu cầu kiểm tra chuyên ngành.

Bước 3: Nộp thuế và các khoản thu khác (nếu có)

Sau khi tờ khai được chấp nhận, doanh nghiệp thực hiện nghĩa vụ tài chính với Nhà nước bao gồm thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu, thuế GTGT, thuế TTĐB (nếu có) và các khoản thu khác theo quy định. Việc nộp thuế có thể thực hiện trực tuyến qua ngân hàng hoặc qua Cổng thanh toán điện tử của Tổng cục Hải quan.

Bước 4: Kiểm tra thực tế hàng hóa (nếu thuộc luồng đỏ)

Nếu tờ khai thuộc luồng đỏ, công chức hải quan sẽ tiến hành kiểm tra thực tế hàng hóa. Doanh nghiệp phải đưa hàng hóa đến địa điểm kiểm tra theo yêu cầu, mở hàng, xếp dỡ để phục vụ việc kiểm tra. Kết quả kiểm tra sẽ là căn cứ để cơ quan hải quan quyết định thông quan hoặc xử lý vi phạm (nếu có).

Bước 5: Thông quan hàng hóa

Sau khi hoàn thành tất cả các nghĩa vụ và đáp ứng đủ điều kiện, cơ quan hải quan thực hiện thông quan hàng hóa trên hệ thống điện tử. Doanh nghiệp có thể nhận hàng và đưa vào lưu thông. Thời gian trả hồ sơ và thông quan được thực hiện ngay trong ngày nếu hồ sơ hợp lệ và hoàn thành nghĩa vụ thuế.

2. Điều kiện thực hiện thủ tục hải quan trong vận tải đa phương thức

Doanh nghiệp cần đáp ứng các điều kiện cơ bản sau:

Điều kiện về chủ thể: Doanh nghiệp phải có chức năng xuất nhập khẩu hoặc kinh doanh vận tải đa phương thức. Người khai hải quan phải có tư cách hợp pháp; trường hợp sử dụng đại lý hải quan, đại lý phải đáp ứng điều kiện hoạt động theo quy định.
Điều kiện về hàng hóa: Hàng hóa không thuộc danh mục cấm hoặc tạm ngừng xuất khẩu, nhập khẩu. Đối với hàng hóa kinh doanh có điều kiện, phải đáp ứng đầy đủ các yêu cầu theo pháp luật chuyên ngành.
Điều kiện về chứng từ vận tải: Có vận đơn đa phương thức (Multimodal Transport Bill of Lading) hoặc chứng từ vận tải tương đương, thể hiện hành trình, phương thức vận chuyển và trách nhiệm của người chuyên chở.
Điều kiện về địa điểm làm thủ tục: Thủ tục hải quan được thực hiện tại cửa khẩu nhập đầu tiên hoặc cửa khẩu xuất cuối cùng, trừ trường hợp được phép vận chuyển hàng hóa chịu sự giám sát hải quan đến địa điểm làm thủ tục khác theo quy định.

Xem thêm: Thủ tục hải quan hàng sản xuất xuất khẩu mới

3. Hồ sơ cần chuẩn bị khi thực hiện thủ tục hải quan trong vận tải đa phương thức

Theo quy định, bộ hồ sơ cần chuẩn bị đầy đủ và chính xác bao gồm:

Tờ khai hải quan hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu: Doanh nghiệp khai và nộp qua Hệ thống xử lý dữ liệu điện tử tập trung của Tổng cục Hải quan.
Chứng từ vận tải: Vận đơn đa phương thức (FBL) hoặc vận đơn đường biển (Bill of Lading), vận đơn hàng không (Airway Bill), các chứng từ vận tải đa phương thức khác.
Hóa đơn thương mại (Commercial Invoice): Thể hiện giá trị, mô tả hàng hóa, điều kiện giao hàng (Incoterms).
Hợp đồng thương mại (Sales Contract): Trong trường hợp hàng hóa xuất nhập khẩu theo hợp đồng.
Phiếu đóng gói hàng hóa (Packing List): Chi tiết về số kiện, trọng lượng, kích thước của hàng hóa.
Giấy phép xuất khẩu, nhập khẩu (nếu có): Đối với hàng hóa thuộc diện quản lý theo giấy phép của các Bộ, ngành quản lý chuyên ngành.
Giấy chứng nhận xuất xứ (C/O): Tùy theo yêu cầu của từng hiệp định thương mại mà hàng hóa áp dụng.
Các chứng từ khác theo quy định của pháp luật chuyên ngành: Giấy chứng nhận kiểm dịch, giấy chứng nhận vệ sinh an toàn thực phẩm, giấy chứng nhận chất lượng, v.v.

Xem thêm: Nhân viên khai báo hải quan tiếng Anh là gì? Tìm hiểu

4. Chi phí thực hiện thủ tục hải quan trong vận tải đa phương thức

Các khoản chi phí chính bao gồm:

Lệ phí hải quan: Theo quy định, lệ phí khi làm thủ tục hải quan điện tử thường được miễn hoặc thu ở mức tối thiểu. Tuy nhiên, doanh nghiệp cần nắm rõ các quy định hiện hành để dự trù ngân sách.
Chi phí kiểm tra chuyên ngành: Nếu hàng hóa thuộc diện phải kiểm tra chất lượng, kiểm dịch, an toàn thực phẩm… doanh nghiệp phải trả chi phí cho các cơ quan kiểm tra chuyên ngành thực hiện.
Chi phí lưu kho, bãi, hạ container: Phát sinh trong thời gian chờ thông quan hoặc khi hàng hóa bị kiểm tra thực tế.
Chi phí thuê đại lý làm thủ tục hải quan: Nếu doanh nghiệp sử dụng dịch vụ của đại lý hải quan, chi phí này sẽ được tính dựa trên thỏa thuận giữa hai bên.
Chi phí vận chuyển nội địa, xếp dỡ: Liên quan đến việc di chuyển hàng hóa từ cảng, ga, sân bay về kho hoặc ngược lại.

5. Dịch vụ hỗ trợ thủ tục hải quan trong vận tải đa phương thức tại ACC HCM

Sử dụng dịch vụ của ACC HCM là giải pháp tối ưu giúp doanh nghiệp yên tâm tập trung vào hoạt động sản xuất kinh doanh cốt lõi:

Tiết kiệm chi phí: Chúng tôi tối ưu hóa quy trình, giảm thiểu tối đa thời gian lưu kho, bãi và các chi phí phát sinh không đáng có, giúp doanh nghiệp tiết kiệm một khoản chi phí đáng kể so với việc tự thực hiện.
Đội ngũ chuyên gia: Sở hữu đội ngũ chuyên gia giàu kinh nghiệm, am hiểu sâu sắc về luật pháp quốc tế và các quy định hải quan nội địa, chúng tôi đảm bảo xử lý hồ sơ một cách chính xác và nhanh chóng nhất.
Tư vấn chuyên sâu: Chúng tôi cung cấp các giải pháp tư vấn chiến lược về mã HS Code, xuất xứ hàng hóa, các hiệp định thương mại tự do (FTA) để doanh nghiệp tận dụng tối đa ưu đãi thuế quan.
Hỗ trợ toàn diện: Từ khâu chuẩn bị chứng từ, khai báo hải quan điện tử, theo dõi quá trình xử lý, đến giải quyết các vướng mắc phát sinh với cơ quan hải quan, chúng tôi đồng hành cùng doanh nghiệp trong suốt quá trình.

6. Câu hỏi thường gặp

Thời gian tối đa để hoàn thành thủ tục hải quan cho hàng hóa vận tải đa phương thức là bao lâu?

Đối với hàng hóa thuộc luồng xanh (miễn kiểm tra chi tiết), thời gian xử lý thường được thực hiện ngay trong ngày làm việc. Đối với luồng vàng (kiểm tra hồ sơ), thời gian tối đa là 2 giờ kể từ khi tiếp nhận đầy đủ hồ sơ. Đối với luồng đỏ (kiểm tra thực tế), thời gian tối đa là 8 giờ làm việc kể từ khi nhận được đầy đủ thông tin và hàng hóa tại địa điểm kiểm tra.

Hàng hóa vận tải đa phương thức có bắt buộc phải làm thủ tục hải quan tại cửa khẩu nhập đầu tiên không?

Theo quy định tại Nghị định 167/2025/NĐ-CP sửa đổi Nghị định 167/2025/NĐ-CP sửa đổi Nghị định 08/2015/NĐ-CP, hàng hóa vận chuyển đa phương thức phải được làm thủ tục hải quan tại cửa khẩu nhập đầu tiên hoặc cửa khẩu xuất cuối cùng.

Nếu phát hiện sai sót trong tờ khai hải quan đã nộp thì xử lý như thế nào?

Trong trường hợp phát hiện sai sót trong tờ khai hải quan đã nộp nhưng hàng hóa chưa được thông quan, doanh nghiệp có thể thực hiện khai bổ sung theo quy định tại Thông tư 39/2018/TT-BTC sửa đổi Thông tư 38/2015/TT-BTC.

Thủ tục hải quan trong vận tải đa phương thức là một quy trình phức tạp đòi hỏi sự chính xác và cập nhật liên tục. Việc nắm vững các quy định pháp luật và lựa chọn một đối tác uy tín sẽ giúp doanh nghiệp tối ưu hóa hoạt động logistics, giảm thiểu rủi ro và nâng cao hiệu quả kinh doanh. Để được tư vấn chi tiết và hỗ trợ tốt nhất, hãy liên hệ ACC HCM ngay hôm nay.